克隆载体基本特征(除了常规的酶切连接外)
对于做过分子实验的小伙伴来说,传统的分子克隆技术——酶切连接大家应该都是比较熟悉的,那么对于其他的分子克隆技术类型大家有了解过吗?根据不同的实验需求,来选择不同的分子克隆技术以及产品。本期,大家和小编一起来了解下几种常规的分子克隆技术吧。
一、酶切连接
酶切连接法属于经典的分子克隆方法,利用限制性内切酶切割DNA和利用DNA连接酶连接DNA,最后转化筛选及纯化,完成重组基因的大量制备。
图1 酶切连接流程
成功的酶切和有效的连接是分子克隆实验圆满完成的必要条件。限制性内切酶能特异性地结合于能被限制性内切酶识别的DNA序列之内或其附近的特异性位点上,并切割双链DNA。根据限制酶的识别切割特性、催化条件及是否有修饰酶活性,可分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型三类。分子克隆技术中最常用的是Ⅱ型酶,切割后得到的是带粘性末端或平末端的线性DNA。粘性末端,即限制性内切酶在DNA双链上交错切割,形成的核苷酸顺序互补的,可形成氢键的末端(见图2)。平齐末端,限制性内切酶在DNA双链的相同位置切割DNA分子,这样形式的断裂是形成具有平末端的DNA片断(见图3)。
图2 EcoR I切割DNA形成粘性末端DNA片段
图3 AluI切割DNA形成平末端DNA片段
爱必信拥有目前常用的如快速内切酶BsaI(abs60206)、快速内切酶ClaI(abs60209)、快速内切酶EcoRI(abs60213)、快速内切酶HindIII(abs60217)等在内的四十多款限制性内切酶。
表1 爱必信限制性内切酶介绍
货号 |
产品名称 |
规格 |
产品特点 |
abs60200 |
快速内切酶ApaLI |
200T |
5-15min即可完成酶切;
大大简化了酶切反应;
极低的星号活性;
轻松应对过量、复杂底物;
经验证所有Absin快速内切酶与其他品牌酶切体系相互兼容。 |
abs60201 |
快速内切酶AscI |
50T | |
abs60202 |
快速内切酶AvrII |
25T | |
abs60203 |
快速内切酶BamHI |
500T | |
abs60204 |
快速内切酶BclI |
125T | |
abs60205 |
快速内切酶BglII |
100T | |
abs60206 |
快速内切酶BsaI |
50T | |
abs60207 |
快速内切酶BstBI |
100T | |
abs60208 |
快速内切酶BstEII |
100T | |
abs60209 |
快速内切酶ClaI |
50T | |
abs60210 |
快速内切酶DpnI |
50T | |
abs60211 |
快速内切酶DpnII |
50T | |
abs60212 |
快速内切酶EagI |
25T | |
abs60213 |
快速内切酶EcoRI |
600T | |
abs60214 |
快速内切酶EcoRV |
200T | |
abs60215 |
快速内切酶Esp3I(BsmBI ) |
30T | |
abs60216 |
快速内切酶FspI |
50T | |
abs60217 |
快速内切酶HindIII |
500T | |
abs60218 |
快速内切酶HinfI |
500T | |
abs60219 |
快速内切酶HpaI |
50T | |
abs60220 |
快速内切酶KpnI |
200T | |
abs60221 |
快速内切酶MluI |
100T | |
abs60222 |
快速内切酶MnlI |
50T | |
abs60223 |
快速内切酶NcoI |
30T | |
abs60224 |
快速内切酶NdeI |
200T | |
abs60225 |
快速内切酶NheI |
30T | |
abs60226 |
快速内切酶NotI |
50T | |
abs60227 |
快速内切酶NruI |
50T | |
abs60228 |
快速内切酶NsiI |
25T | |
abs60229 |
快速内切酶PacI |
25T | |
abs60230 |
快速内切酶PstI |
500T | |
abs60231 |
快速内切酶PvuII |
200T | |
abs60232 |
快速内切酶SacI |
100T | |
abs60233 |
快速内切酶SacII |
50T | |
abs60234 |
快速内切酶SalI |
200T | |
abs60235 |
快速内切酶SbfI |
25T | |
abs60236 |
快速内切酶SmaI |
100T | |
abs60237 |
快速内切酶SpeI |
50T | |
abs60238 |
快速内切酶SphI |
50T | |
abs60239 |
快速内切酶SspI |
60T | |
abs60240 |
快速内切酶StuI |
100T | |
abs60241 |
快速内切酶TaqI |
200T | |
abs60242 |
快速内切酶XbaI |
500T | |
abs60243 |
快速内切酶XhoI |
500T | |
abs60244 |
内切酶SgeI |
250U |
核酸片段可以通过连接酶的作用连接起来而获得重组分子。DNA接酶催化双链DNA子中相邻碱基的5’-P末端与3-0H间形成3’,5’-磷酸二酯键。常用的DNA连接酶是T4 DNA连接酶——T4 DNA Ligase(abs60084),被称为生物界的“502”。在有Mg2 和ATP存在的条件下,T4 DNA Ligase能催化双链DNA或RNA上相邻的5´-磷酸末端和3´-羟基末端形成磷酸二酯键。该酶不仅能够催化双链DNA的平末端或粘性末端之间的连接,还可以修复双链 DNA、RNA或 DNA/RNA 杂交双链中的单链切刻,但不能催化单链DNA之间的连接。
图4 T4 DNA连接酶作用位点
二、TA克隆
TA克隆是指把PCR片段与一个具有3‘-T突出的载体DNA连接起来的方法。可用于不清楚目的基因的DNA序列,获得的目的片段通常需要通过TA克隆的方法重组到T-载体中,通过测序测定DNA序列。爱必信T-Vector快速克隆试剂盒(abs60085)是高效、便利的PCR产物克隆专用试剂盒。
爱必信T-Vector快速克隆试剂盒(abs60085)产品特点:1、阳性率高:高纯度酶切型线性T载体,连接效率更高,蓝斑率低于10% 。2、方便快捷:预混连接反应体系,最快5分钟实现连接,无需纯化,直接转化。3、T Simple载体无常用酶切位点,利于含酶切位点基因克隆。4、无NdeI或NcoI位点,便于重组表达基因的克隆。5、提供纯化的PCR片段作为阳性质控对照 。6、 蓝白筛选:高表达活性的β-半乳糖苷酶,显色更快更深 。7、批次稳定:遵循标准化生产流程,经过严格的质量检测。
图5 TA克隆流程
三、无缝克隆
无缝克隆技术是一种新的、快速、简洁的克隆方法,可以在质粒的任何位点进行一个或多个目标DNA的片断的插入,而不需要任何限制性内切酶和连接酶,只需要一步重组法,即可得到高效率克隆的重组载体,大大提高了工作效率。爱必信快速多片段DNA组装预混液(abs60250)就是基于重组原理的无缝克隆技术,它不依赖繁琐的酶切、连接步骤,也不需要末端补平等操作,依据DNA片段与线性化载体末端的15~25 nt同源序列的重组,可将插入片段克隆至任意线性载体的任意位点,载体自连背景极低,是一种简单、快速、高效的DNA定向克隆技术。
爱必信快速多片段DNA组装预混液(abs60250)特点:
1.简单便捷:兼容PCR产物体系与载体酶切体系,省去繁琐的纯化步骤;
2.高阳性率:定向克隆单个DNA片段至载体上,阳性率高于95%;
3.快速反应:反应时间大大缩短,最快仅需5min。
4.单片段、多片段均可连接:单个或多个片段同时插入,省去重复纯化与酶切过程。
图6 爱必信快速多片段DNA组装预混液(abs60250)无缝克隆操作流程
四、TOPO克隆
TOPO克隆实际是基于拓扑异构酶的克隆技术,关键是拓扑异构酶。该技术不需要限制性内切酶或外源连接酶,从而提供了将新的PCR产物克隆到质粒中的极其简便快捷的方法。
表2 爱必信TOPO克隆产品
货号 |
产品名称 |
规格 |
产品特点 |
abs60091 |
T-Vector pTOPO快速克隆试剂盒 |
20T/100T |
快捷,不需连接酶,克隆三步到位 |
abs60094 |
Blunt pTOPO快速克隆试剂盒 |
20T/100T | |
abs60095 |
pBM16A Toposmart快速克隆试剂盒 |
20T/3×20T | |
abs60096 |
pBM27 Toposmart快速克隆试剂盒 |
20T/3×20T |
五、Geteway克隆
Geteway克隆利用位点特异重组实现目的片段的插入的,载体上的一段目的片段在重组酶的作用下会替换成目的片段,不依赖限制性内切酶和连接酶,导入目的基因不需要开环处理,载体需要用试剂盒提供的载体,一般需要用到两个载体,快速、高效将DNA序列转移到载体上的克隆。
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