硬盘技术详解(硬盘过时是迟早的事)
1878 年 6 月 19 日,英国著名摄影师埃德沃德·迈布里奇(Eadweard Muybridge)把 12 台双镜头照相机列成一排,拍摄一名骑手骑马快速奔跑的场景。最初的目的是想解决困扰了画家和艺术家几个世纪的难题——马在奔跑时四条腿是否可以同时离地。
(左边是原始动画,右边是从细菌 DNA 中复原的动画)
明尼苏达大学(University of Minnesota)的数学教授兼数字技术专家 Andrew Odlyzko 称这项新研究「非常了不起」。
「想象一下,我们可以把秘密交给位于我们肠道或者皮肤上的细菌,这应该是最安全的保密方式了,」他说道。
让细菌「监控」神经元此前,科学家已经成功将莎士比亚的十四行诗存入了 DNA 中。2012 年,Church 将自己的书《Regenesis》的电子数据编辑成 DNA 形式导入了细菌体内,并通过细菌繁殖得到了 900 亿份复制品。
「这应该是出版史上的最高纪录了,」Church 在采访中说道。
(哈佛大学遗传学家 George Church,图片来源:Harvard University)
在这些研究的基础上,Church 和其他科学家开始酝酿一个更大胆的想法——能否将改造过的细菌植入人体细胞,记录下细胞的一举一动。换句话说,就是像拍电影一样录下每个细胞的生活。
当人生病时,医生可以将这些细菌提取出来,观察存储在 DNA 中的录像。Church 说,这就像飞机失事后人们可以通过黑匣子知道当时发生的情况一样。
大脑包含约 860 亿个神经元,然而要想知道这些神经细胞的日常活动却是一件非常困难的事。
「目前,我们可以用电极来观察神经元的活动,但是一个电极只能监控一个神经细胞。人的脑子装的下 860 亿个神经元,可装不下 860 个电极啊,」Church 说道。不过,经过改造的细菌或许是理想的「侦察兵」。
科学家的想法是,通过基因工程将细菌改造成「记录装置」,然后让这些细菌随着血液到达大脑,记录大脑神经元的活动。随后科学家可将这些细菌提取出来,通过其 DNA 就能知道神经元在这段时间的活动状态。
Church 和他的同事已经在过去的研究中展示了细菌能记录细胞中被标记的 DNA。
存储能力甩硬盘几条街的 DNA半个世纪前,著名物理学家理查德·费曼(Richard Feynman)就提出了用 DNA 来存储信息这一超前想法。很久之后分子生物学革命才兴起,几十年后才有科学家成功地做到了给 DNA 测序。
「基因不仅仅是文字信息,它也能做一些自己的事,」费曼在 1959 年的一次演讲中说道。
「想象一下,我们也能做出一件非常小的东西,让它做我们想做的事,」他激动地说道。
「费曼博士的想法意义深远——它给我们提供了一个方向,」南加州大学的数学家 Leonard Adleman 说道。他还是「RSA」——使用最广泛的一种公钥加密算法——的创建者之一。
1994 年,Adleman 宣布他已经成功将数据存入了 DNA 中,并把 DNA 当作电脑解决了一个数学问题。他坚信,DNA 的存储能力是同样大小光盘的一万亿倍还不止。
数据存储是一个越来越让人头疼的问题。在这个知识爆炸的年代,每天产生的数据数量惊人,因而储存数据的技术一不小心就过时了,比如被淘汰掉的软盘。
但 DNA 永远都不会过时。「数十亿年来,生物都在用 DNA 存储信息,而且信息都保存完整,」Adleman 说道。他注意到,现代的细菌仍然能从几百万年前的昆虫琥珀中读取到基因信息。这是因为 DNA 很容易保存,只需放在冷、暗、干燥处,没有恒温恒湿的苛刻要求。它还非常稳定,存放上百万年都没问题。
除此之外,DNA 合成测序,使用的设备和方法都是生物学研究的常规工具。这使得 DNA 的存储有效地避开了因设备技术更新换代而起的许多麻烦。所以 DNA 是数码信息长期存储的理想材料,而且存储的时间越长,越能显出优越性。
DNA 真正取代硬盘还要多久?DNA 作为存储介质,也有显著的弱点。首先是成本太高。欧洲生物信息研究所(EBI)的高德曼团队的实验费用高得惊人:每一兆字节的存储费用是 12,400 美元,外加测序解读 220 美元。这是常规磁带存写费用的一百多万倍。
第二,信息读写非常耗时。数码信息编入 DNA 目前只能由专门的 DNA 合成设备来做;而从 DNA 中读取信息,重组复原为数码文件也很费时。高德曼团队用了整整两个星期,才完成五个文件 739 千字节的复原。
第三,DNA 介质不能重复使用,写录完毕,一般来说不能修改、不能再用。可是,我们已经习惯了常规存储,如硬盘和 U 盘的便利。几十块钱的 U 盘,插入电脑,就能周而复始地存取文档。
这些「简单」的基本功能,DNA 介质却难以胜任。
(硬盘、U 盘、细菌 DNA 在读写速度、数据保留时间、耗电量、数据密度上的对比,图片来源:Nature)
「人们的本能反应是,DNA 分子那么渺小,怎么能储存海量信息呢?」Birney 博士说到。
「尽管这些想法很超前,但我们起码知道,这些生物技术诞生的时间肯定前人预测的要早,」Church 说到。
他举出了人类基因组测序的例子。此前,一些比较乐观的科学家预测这将花费至少 60 年的时间,每组基因测序的费用将高达 1000 美元(测完人类 30 亿个碱基对将需要 3 万亿美元)。而于 1990 年正式启动的「人类基因组计划」只用了十年时间,花费 30 亿美元。
DNA 存储着生物体的奥秘,是个非常大的「数据盘」。当克服了存储和读取上的难题,也许未来某一天,我们所有的硬盘、U 盘、网盘都可以丢到一边。用一块硬币大小的 DNA,就能存储我们一生需要的数据了。
参考资料:The New York Times
头图来源:Geenius
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