ssr原理图（六步搞定SSR引物设计）
PCR实验中，引物设计占有十分重要的地位。下面我们就来介绍一下SSR引物设计的方法：
其中红色部分为SSR位点位置2.将各碱基重复的表格按照重复次数从高到低排序，理论上重复次数越多多态性越高。3.在Excel表格中去除SSR位点靠前或者靠后的序列，比如序列c12900SSR位点过于靠前，c58603SSR位点过于靠后均无法设计SSR引物.4.在原始数据中查找初筛后的数据如c20128进行查找相应序列，将序列输入Primer6设计引物。
5.引物设计时因考虑到扩增片段的长度一般150-350bp，可以在SSR位点的前后200bp设计：
6.挑选分数大于80.0，扩增片段为150-350bp的高分引物，最好设计50对进行挑选，注意设计的引物不可与SSR位点区段重叠（此例子中SSR位点区段为552-581）。此例中挑选的为第五条。
要求：1 引物长度18-22 bp2 扩增产物100-250 bp3 GC含量35%-65%4 碱基重复次数不多于4，尤其是G或C的单碱基重复最好少于35 两个引物Tm值差异控制在2℃范围内
,
免责声明：本文仅代表文章作者的个人观点，与本站无关。其原创性、真实性以及文中陈述文字和内容未经本站证实，对本文以及其中全部或者部分内容文字的真实性、完整性和原创性本站不作任何保证或承诺，请读者仅作参考，并自行核实相关内容。文章投诉邮箱：anhduc.ph@yahoo.com
