蜘蛛基因与人类基因融合(蜘蛛也有自己的个性)

论文标题:Are personalities geneticallydetermined? Inferences from subsocial spiders

期刊:BMC Genomics

作者:JessicaPurcell & JonathanN. Pruitt

发表时间:2019/11/22

DOI:10.1186/s12864-019-6172-5


与其他物种相似,蜘蛛也会表现出可以被描述为“个性”的个体行为。在这篇发表于BMC Genomics的文章中,作者阐明了基因对这一现象的影响。


蜘蛛基因与人类基因融合(蜘蛛也有自己的个性)(1)


养宠物的人会意识到动物在行为上有很大的个体差异。例如,一些狗在参观一个新地方时很好奇,很独立,而另一些狗则很胆小,会观察主人的反应。研究动物行为的研究人员现在认识到,同种动物个体之间的这种差异(有时被称为“动物性格”)是普遍存在的,并影响着个体与环境的相互作用。


读者们可能会惊讶地发现,尽管蜘蛛个头很小,但它们一直是动物性格变化研究的重点。一些种类的蜘蛛表现出一系列协调的行为特征,这些特征在不同个体之间有所不同,但一定时间内在某个特定个体中却非常一致。这些行为通常介于“大胆”和“羞怯”之间。大胆的个体能从假装的攻击中快速恢复,并且在攻击一个被蛛丝缠绕的新猎物时具有较短的延迟期,而羞怯的个体在攻击猎物前往往会花更多的时间来装死。


在过去的十年里,这些个性特征已经在不同的生态和社会环境中被研究过。虽然之前的多代研究提供了一些证据,表明一些性格特征可能会从亲本那里遗传给后代,但我们对这些复杂行为特征的遗传基础缺乏了解。即使在蜘蛛之外,对行为特征的遗传学研究也落后于对身体特征的研究,比如体色。这有几个原因,首先,测量行为是具有挑战性的,因为它必须用活的有机体来完成。其次,研究人员认为,行为是由基因和个体之前的经历共同决定的,因此,基因变异和行为特征之间不太可能存在完美的联系。最后,考虑到许多行为特征的复杂性,我们预计它们会受到多个基因的影响,而发现这种模式的能力却是有限的。


在一定时间内,蜘蛛个体会表现出一致的行为


然而,寻找与感兴趣的特征相关的遗传标记很重要,它使我们能够调查行为的起源和潜在原因。遗传标记也成为未来研究的一个有价值的工具。BMC Genomics 上的一项新研究试图通过识别与栉足蛛(Anelosimus studiosus)的性格特征相关的遗传标记来填补这一知识空白。


今天,基因组学的进步促进了对生物体中遗传关联的研究,而这在以前的遗传研究中并不是重点。为了使用这些新兴的工具,Jonathan Pruitt和我对田纳西州东部河流和湖泊的蜘蛛进行了采样。我们使用了标准的行为测试(惊吓测试)来确定每个蜘蛛个体在受到干扰后的恢复时间(在这种情况下,间断的空气气流作用于蜘蛛的身体)。在测试后动作很快的蜘蛛被认为是大胆的,而那些几分钟内持续装死的个体被认为是羞怯的。由于该物种在环境中生活于多雌群居群体或单独的巢穴中,我们还记录了每个个体来源群体的社会结构。


蜘蛛基因与人类基因融合(蜘蛛也有自己的个性)(2)


Pruitt和他的同事先前证明了社会群体是由大胆和羞怯的个体组成的,所以这两个变量(社会性和大胆)被分开考虑。在对这些行为特征进行评分后,我们使用双重消化限制性酶切位点关联的DNA测序(ddRADseq)对200多只蜘蛛的基因组中约0.1%的部分进行了测序。同时,我们对一个蜘蛛个体的全基因组进行测序和组装。尽管由于蜘蛛基因组具有挑战性(基因组较大且具有大量的重复序列),基因组组装后仍然高度碎片化,但这个基因组帮助我们确定了ddRADseq标记的相对位置。


最终,我们确定了一组与蜘蛛胆大的个性相关的7个遗传标记。在每个标记处,携带有两个该片段的拷贝(= 纯合子)往往更大胆,而携带另一种序列的纯合子个体往往更胆小。杂合的个体(即每个序列都只有一个拷贝的个体)往往表现出居中的恢复时间。这些标记相互关联,基因组的这个区域解释了胆大这一特性中11%的变异。


基因标记相互联系,形成每只动物的“个性”


这表明,这一基因组区域对蜘蛛性格有显著影响,但也表明这不是基因组中唯一影响性格的部分。我们还不知道这些标记是否在一个基因内,或者这个基因组区域是否影响基因调控。我们没有发现任何与每个个体的社会结构相关的标记。就社会结构和个性而言,我们的基因组扫描很可能漏掉了有趣的变异,因为只研究了每个蜘蛛个体基因组的一部分。


尽管如此,蜘蛛性格特征遗传基础的发现开辟了多个新的研究方向。研究新发现的基因组区域附近的基因及其功能,将开始揭示它们如何影响行为。在生物个体的层面上,我们可以衡量每个基因变异如何影响个体和群体的成功。在种群水平上,我们可以研究维持这种遗传变异的机制。


总而言之,这项研究迈出了激动人心的第一步,将当代动物行为和遗传学研究融合到这个广泛存在的有趣物种中。更广泛地说,由于这种现象在动物中非常普遍,这一发现有助于我们在更大范围的生物群体中理解动物的个性。

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